2021年12月29日，Journal of Genetics and Genomics 在線發(fā)表國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺團(tuán)隊(duì)和深圳華大生命科學(xué)研究院精準(zhǔn)健康研究所和超級細(xì)胞所團(tuán)隊(duì)合作題為“CDCP: a visualization and analyzing platform for single-cell datasets”的研究論文。該論文介紹了單細(xì)胞數(shù)據(jù)可視化分析平臺CDCP可提供全面的單細(xì)胞數(shù)據(jù)資源和便捷的可視化在線分析工具。

      CDCP是一個(gè)單細(xì)胞數(shù)據(jù)集成、共享、分析的綜合平臺。其主要功能包括：1. 用戶可以在線獲取CDCP收錄數(shù)據(jù)集中樣本的詳細(xì)信息，并允許下載每個(gè)單細(xì)胞數(shù)據(jù)集的原始序列和表達(dá)矩陣；2. CDCP提供了一個(gè)共享和集成單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)集平臺，并允許用戶上傳數(shù)據(jù)，可以實(shí)時(shí)更新；3. CDCP允許使用tSNE細(xì)胞降維圖、不同細(xì)胞類型的聚類分析圖以及顯示不同細(xì)胞類型數(shù)量的直方圖對每個(gè)單細(xì)胞數(shù)據(jù)集進(jìn)行可視化，其中多個(gè)基因在不同細(xì)胞類型或簇中的表達(dá)模式可通過聚類圖和小提琴圖顯示。此外，CDCP還提供一個(gè)用戶友好的分析流程，通過提供單細(xì)胞表達(dá)矩陣，用戶可以在線對感興趣的細(xì)胞數(shù)據(jù)集進(jìn)行重新分析，包括數(shù)據(jù)質(zhì)控、注釋高度可變基因、降維/聚類、分析用于表征群體特征的標(biāo)記基因等。

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